Если говорить про именно атомные бомбардировки, то на перехват одинокого самолёта истребители поднимать не стали - горючки крайне мало, а каких бед один единственный самолёт сможет натворить?
Бомберы же на Западном фронте несли ощутимые потери, как раз из-за ПВО. И ведь всё равно летали.