Как раз с кофе всё было просто - кофе, напиток, это он, мужской род. Растение кофе это оно, средний род.
А вот как с "ложить" быть? Положить, приложить, наложить, подложить, ложиться, уложиться, вложить, заложить, обложить, отложить и т.д. есть, а ложить нет!
Смысл "класть" и "ложить" на сегодня смешался, но "класть" – это только для действий несовершенного вида (класть – что делать?), тогда как "ложить" – совершенный вид (возложить, положить, уложить – что сделать?).
В словаре Даля «ложить» считается вполне литературным словом, тогда как Ушаков говорит о том, что это просторечное выражение.
Срач.