Ну, я бы не сказал, что не смогли победить.
Цель всех этих покорений северных земель была - ясак, сбор пушнины, которая в те времена составляла большую часть экспорта. А чукчи частью оленей разводили, частью на морского зверя охотились, а соболей бить им негде. Поэтому большого количества пушнины с них взять не выходило, а войск держать приходилось по меркам тех мест много. Стоимость снабжения армии значительно превышало стоимость собираемого с чукчей ясака. Поэтому войска вывели и стали с ними торговать, и приручили потихоньку.