Всегда думал, что Хер пришло от немецкого Herr в петровские времена, выражалось как "этот хер", "вон тот хер", "а что этот хер делал?", обозначающий какого то человека мужского пола, в последствии перешедшее в мат.
Думаю, что если бы это был мат в петровские времена, то Петр бы не позволял бы себя так называть.