Если вы вручили заявление, то считайте что уволены.
Заявление не обязательно отдавать начальству, или в отдел кадров. Его может принять секретарь. Нет секретаря, не принимают - отправляете заказным + уведомление по электронной почте и смс. С момента уведомления должен идти срок расчета. Отработка несколько дней, сдача документов и т.п. - это проблемы начальства, а не вашего. Трудовой кодекс важнее любого внутреннего регламента.