Это вечный спор. Я, например, очень аккуратно выкручиваю, лунку сразу засыпаю . Грибнице это не вредит, по сути гриб- как яблоко на яблоне. Плодовое тело. А оставляя часть ножки есть риск, что какая-нибудь гадость , типа бактерий вредных, сможет до грибницы добраться.