вероятно когда то Юпитер был очень близко к Солнцу, как и у других звезд он располагался примерно на орбите Меркурия.Но чехарда во время формирования Солнечной Системы выбросила Юпитер на его современную орбиту, Меркурий был захвачен Солнцем и занял почти его место.
В ранней Солнечной системе было гораздо больше планет, но некоторые поменяли орбиты, некоторые были вообще выброшены за пределы СС.Современное относительно стабильное состояние сложилось с большими потерями.
Пояс астероидов например - разорванная планета, спутники планет гигантов - почти все захваченные из пролетавших по их орбитам планет карликов.Отсюда и разница в составе и строении.