Всё проще.
Когда Мазепа привёл своих козаков к Карлу (обещал пятьдесят тысяч сабель, привел две тыщи), тот распорядился их поставить поперёд шведов, а чтобы шведы не побили этих "партнёров", приказал выдать им прапор цветов шведского флага. Так и появился "жовто-блакытный". Изначально он был сверху жовтый, а снизу блакытный, перевернули его во время кайзеровской УНР.
yaplakal.com