Там три флага - ВМСУ + государственные греческий и турецкий.
Точно не помню, но вроде как при нахождении в чужих территориальных водах(12-мильная зона) военному кораблю положено поднимать также флаг страны, которой эти воды принадлежат в знак признания её суверенитета над этими водами. А во всяких босфорах-дарданеллах и на Кипре есть места, где греческие и турецкие территориальные воды смыкаются потому приходится поднимать оба флага.