Но в 1921 г. во Владивостоке прошла страшная эпидемия лёгочной чумы, длившаяся пол года и на территории госпиталя был развёрнут так называемый "Чумный городок", принявший на себя основной поток больных из города. Эпидемия была настолько страшной, что по словам главврача ГКИБ в то время в госпитале от заражения чумой погибли практически все врачи.
П после окончания Гражданской войны и освобождения Владивостока от интервентов, госпиталь был отреставрирован и продолжил свою работу по прямому назначению, пока в 1925 г. не началась застройка Эгершельда, а на на базе старых домовладений и некоторых восстановленных строений лазарета не был создан рабочий социалистический городок.
А в 1931 г. во Владивостоке был создан отдел здравоохранения, приказом которого на полуострове Шкота была создана заразная больница и ещё несколько освободившихся построек бывшего госпиталя перешли в гражданское управление под различные городские нужды.
В 1970-х гг. большую часть построек госпиталя и вовсе снесли при застройке жилого района, а территория больницы сократилась до размеров небольшого квартала. К слову несколько зданий на территории до сих пор действуют в качестве Городской Инфекционной Больницы №1.