Тип VIIC U-203 была построена на верфи № 632 компании Friedrich Krupp Germaniawerft AG в Киле. Она была заложена 28 марта 1940 года, спущена на воду 4 января 1941 года и вступила в строй 18 февраля под командованием капитан лейтенанта Рольфа Мютцельбурга. U-203 совершила одиннадцать патрулей в составе первой флотилии, и ей приписывают потопление 21 корабля водоизмещением 94 270 брутто-регистровых тонн (брт) и повреждение еще трех кораблей общим весом 17 052 брт.
Она была членом одиннадцати волчьих стай. Была потоплена британскими палубными самолетами и британским военным кораблем к юго-востоку от Гренландии 25 апреля 1943 года.
Первый, второй и третий патрули 24 июня 1941 года, через девятнадцать дней после своего первого патрулирования по пути из Киля в Сен-Назер во Франции, U-203 атаковала и потопила британское торговое судно водоизмещением 4956 брт «Кинросс», входившее в состав конвоя OB 336. Позже в тот же день она атаковала норвежский корабль Soløy водоизмещением 4402 брт, который находился в составе конвоя HX 133. Прибыв в Сен-Назер 29 июня, экипаж U-203 оставался на берегу еще одиннадцать дней, прежде чем лодка совершила второй патруль. Через семнадцать дней она атаковала конвой OG 69, направлявшийся в Гибралтар. 27 числа U-203 потопила британское торговое судно «Хокинг» водоизмещением 2475 брт. Британская «Лапландия» и шведская «Норита», также торговые суда OG 69, были потоплены на следующий день, добавив к рекорду подводной лодки еще 1330 брт и 1516 брт соответственно.
Через шесть дней после своего третьего патруля она присоединилась к атаке волчьей стаи на конвой HG 73. 26 сентября она потопила британские корабли Avoceta и Chixwing, а также норвежский Varanberg, уничтожив еще 7362 брутто-тонных корабля. В результате затопления Авосеты погибло 123 человека. Четвертый, пятый и шестой патрули через шестнадцать дней после своего четвертого патрулирования, 3 ноября, U-203 атаковала и потопила Empire Gemsbuck (5626 брутто) и Everoja (4830 брутто), британские торговые суда конвоя SC 52. Через двадцать один день своего пятого патрулирования, 15 января 1942 года, U-203 потопила небольшой (632 брт) португальский корабль «Каталина». Два дня спустя норвежский корабль «Октавиан» также был потоплен. Шестой патруль U-203 привел к общей потере союзниками 14 232 брутто-тонн и повреждению еще двух кораблей, в том числе британских торговых судов San Delfino и Empire Thrush. Повреждения получили американский танкер Генри Ф. Синклер-младший и танкер под панамским флагом Stanvac Melbourne.
Седьмой, восьмой и девятый патрули Седьмое патрулирование, начавшееся 4 июня 1942 года, привело к уничтожению 32 985 (брт). Бразильский «Педриньяс» и британский «Путни-Хилл» были затоплены 26 июня. Двумя днями позже американский корабль «Либерти Сэм Хьюстон» был торпедирован, а затем добит 43 выстрелами из палубной пушки. Британский «Кабо-Верде» был потоплен 9 июля, а панамский танкер «Станвак Палембанг» — 11 июля, в результате чего в этом успешном патрулировании было одержано пять побед. Следующий 23-дневный патруль оказался безрезультатным, однако командир подводной лодки Рольф Мюцельбург погиб во время этого патруля 11 сентября.
Воспользовавшись возможностью искупаться в Атлантическом океане к юго-западу от Азорских островов, он нырнул из боевой рубки и ударился головой и плечом о палубу, когда подводная лодка внезапно накренилась на волнах. Врач с U-462, подводной лодки снабжения «Молочная корова», прибыл на следующий день, но слишком поздно. Рольф Мютцельбург был похоронен в море 12 сентября 1942.
Герман Коттман, который стал капитаном до конца карьеры U-203. Ее девятый патруль, начавшийся 15 октября 1942 года и завершившийся 6 ноября, привел к потоплению еще двух кораблей. Британские торговые суда Hopecastle и Corinaldo (5178 и 7131 брутто-тонна соответственно) были потоплены 29 и 30 октября во время путешествия с конвоем SL-125. Потеря U-203 предприняла еще два патрулирования, оба безуспешно.
25 апреля 1943 года, находясь к югу от мыса Фэрвелл, Гренландия, она была потоплена глубинными бомбами. Она была атакована самолетами Fairey Swordfish, действовавшими с британского эскортного авианосца HMS Biter и британского эсминца HMS Pathfinder. Десять человек погибли, в живых осталось 38 человек.