Обычно считается, что ниндзя – это члены обособленных кланов, сформировавшихся из людей, оказавшихся в средневековой Японии вне общества: ронинов(самураев оставшихся без князей), бежавших от расправы мятежников и преступников, бродячих монахов (не приписанных ни к одному монастырю), отшельников, а также из жителей уединенных горных селений. Когда в Японии началась эпоха феодальных войн, длившаяся пять веков подряд, их (убийц: ниндзя) стали нанимать для шпионажа и диверсионно – террористической деятельности удельные князья, принадлежавшие к противоборствующим военно – политическим группировкам.
Объясняют это тем, что подобные задачи могли решать не самураи, который подчинялись требованиям ведения войны “по правилам”, а те, кто находился за пределами этих правил. Их презирали, ненавидели и боялись, но пока шли бесконечные войны, обойтись без них не могли! Внутри этих кланов сложилась определенная дисциплина , целью которой являлась теоретическое обоснование наилучших способов незаметного проникновения в ряды противника, выведывание его секретов и сокрушения изнутри. Она получила название “ниндзюцу” – искусство быть невидимым (имеется в виду для противника). Таким образом появились ниндзя – потомственные профессиональные разведчики, шпионы и диверсанты средневековой Японии.