Гвозди, наверняка "впотай" вколочены.
Или, это гвозди без шляпок, вколоченные в основу, на которые потом эти паркетины насажены.
За столько лет, особенно в дубе, следы гвоздей проступят, даже если гвоздя на поверхности и нет. Дубильные вещества из дубовой древесины реагируют с железом, образуя окрашенные вещества. Когда-то так чернила делали.
Или, как вариант, гвозди заколачивали намного позднее, в качестве "ремонта" паркета...