Я не великий геолог, конечно, но 600 млн лет назад на территории Сахары было полным полно воды.
Лишь 5 миллионов лет назад началось ее превращение в пустыню. И... всего 6000 лет назад оно завершилось.
Если судить по фотографиям, "глаз" находится в расщелине. Т.е., место, куда вода стекается в первую очередь и откуда уходит в последнюю. Если посмотреть на мелеющие озера, тоже можно заметить подобный волновой узор ведущих к ним берегов.
Возможно, разные цвета соответствуют просто постепенному обмелению и изменению химического состава воды умирающего моря (он очень сильно меняется в процессе).
Исключительно мое имхо.