Мэттью признается, что не может стоять и смотреть, когда кто-то кричит на собаку или с силой тянет поводок. Ему неоднократно приходилось участвовать в драках, защищая животных на улице.
У Макконахи всегда дома жили собаки.
Своего первого питомца — черного щенка помеси чау-чау и лабрадора — Мэтью взял в приюте в 1993 г. Он дал собаке имя Мисс Худ. Эта собака была верным и преданным другом и компаньоном актера 12 лет. Мисс Худ ездила со своим хозяином на гастроли и часто появлялась вместе с хозяином на фотографиях в прессе. Мэтью очень горевал, когда его любимица умерла от рака в 2005 году.
Через год после смерти Мисс Худ Мэтью Макконахи завел австралийскую пастушью собаку. Актер назвал свою питомицу Фокси. Собаки этой породы очень активные, любят развлечения на свежем воздухе и долгие прогулки. Фокси с удовольствием участвовала в спортивных мероприятиях вместе с актером.
Кроме Фокси Мэтью Макконахи подобрал еще и Билли Джо.
Мэтью Макконахи финансирует компанию «Растем с домашними животными». Эта организация помогает семьям, где есть дети и домашние животные, правильно выстроить взаимоотношения между животными и детьми, а также дает советы по уходу за животными.
Кроме Фокси в семье живет еще и стаффордширский бультерьер Би Джей. Он сопровождает Мэтью в прогулках по пляжу. Однажды Би Джея видели на баскетбольном матче, где Мэтью взял для него бесплатные очки от солнца.
Мэттью ЛИЧНО участвовал в спасательной операции по розыску и спасению потерявшихся животных после урагана «Катрина» в 2005 г., а также оплачивал работу ветеринаров, которые лечили более 50 пострадавших животных.