Ну, во-первых, сильно глубокий вакуум там не нужен. 0,1 атмосферы уже будет прекрасно, а если 0,05 - так и вовсе. Для этого не нужны сверхдорогие насосы.
А во-вторых, основная мякотка будет не в скорости, а в затратах энергии. При скорости выше 70 км/ч большая часть энергии расходуется на то, чтобы растолкать воздух лбом поезда. В этой трубе можно будет ехать 1500 км/ч, а электричества уйдёт как у пригородной электрички. А если ещё рекуперацию наладят - вообще зупа.
Правда такая труба будет шикарной целью для террориста. Причём, теракт будет почти идеальным - минимум жертв, максимум резонанса и материальных потерь.